Das Labor führt chemische und physikalische Untersuchung von Boden- und Wasserproben durch.

Im August 2014 wurde in der Außenstelle Jägerhausgasse der Höhere Bundeslehr- und Forschungsanstalt für Gartenbau Schönbrunn eine Baum-Lysimeteranlage mit 6 Lysimetern errichtet. Diese Anlage ist ein Gemeinschaftsprojekt des Magistrates 22 der Stadt Wien, der HBLV für Gartenbau Schönbrunn, dem Verein LandschafftWasser und dem Bundesamt für Wasserwirtschaft Petzenkirchen.

Lysimeter sind ein wichtiges Instrument zur Messung des Bodenwasserhaushalts und zur Nachvollziehbarkeit von Wasser- und Stoffflüssen im Boden. In der Mikrolysimeteranlage  in Petzenkirchen können die maßgeblichen Prozesse kleinmaßstäblich und unter kontrollierbaren Bedingungen ablaufen. Dies ermöglicht das Testen unterschiedlicher Varianten (zB. Bodenarten, Dünger- oder Schadstoffmengen)   und die Ableitung notwendiger Parameter für eine spätere Modellierung der Wasserbewegung und des Stofftransportes.

Lysimeter sind ein wichtiges Instrument zur Messung des Bodenwasserhaushalts und zur Nachvollziehbarkeit von Wasser- und Stoffflüssen im Boden. Um auch in Grobsedimenten, die oft Träger bedeutender Grundwasservorkommen sind, den Wasserfluss bewerten zu können, wurde ein insgesamt 4 m hoher Zylinder in ungestörter Lagerung im IKT installiert und instrumentiert.

Unmittelbar in der Nähe des BAW-IKT Petzenkirchen befindet sich das hydrologische Freiluftlabor HOAL (Hydrological Open Air Laboratory). Bereits seit der Gründung des BAW-IKT im Jahre 1945 begannen Probennahmen und Untersuchungen in diesem Einzugsgebiet, das von einem ca. 600 m langen Bach entwässert wird. Mittlerweile sind im HOAL mehrere hundert Sensoren für das permanente Monitoring von verschiedensten Stoffflüssen installiert.