Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in für ein Forschungsprojekt im Bereich eDNA zum Screening von Fischen in Seen und Fließgewässern (Vollzeit)
BAW Research ist eine Körperschaft öffentlichen Rechts am Bundesamt für Wasserwirtschaft. Zum ehemöglichsten Zeitpunkt suchen wir ab sofort wissenschaftliche Verstärkung für unser Team im Bereich der Seen- und Gewässerökologie in Scharfling/Mondsee.
Projektdauer: 24 Monate
Rolle: Operative wissenschaftliche Projektbearbeitung mit Schwerpunkt Seen-eDNA (Methodenentwicklung, Laboraufbau/-betrieb, Datenanalyse, Leitfadenentwurf)
Dienstort: Scharfling/Mondsee
Ihre Aufgaben
- Entwicklung und Validierung eines eDNA-Screening-Ansatzes für Fischgemeinschaften in Seen (ergänzend: Auswertung Fließgewässerdaten aus Partnerprojekten)
- Aufbau/Standardisierung eines eDNA-Laborworkflows (Filtration, Extraktion, PCR/Marker-Amplifikation; Sequenzierung extern).
- Selbständige Planung und Durchführung von Feldkampagnen (Probenahmen) an ausgewählten Seen inkl. SOPs, Qualitätssicherung und Probenlogistik.
- Bioinformatik & Statistik: Auswertung von Metabarcoding-Daten (Artenlisten), Vergleich mit Befischungsdaten, Ableitung von Screening-Kriterien.
- Erstellung von Berichten und Arbeitsanweisungen (Probenahme, Labor, Auswertung, Screening-Berechnung) als Grundlage für die Praxis.
- Publikation der erzielten Ergebnisse in wissenschaftlichen Fachjournalen
- Erstellung von Einreichunterlagen für weitere Projekttätigkeiten in diesem Bereich
Ihr Profil
- Abgeschlossenes naturwissenschaftliches Studium (Molekularbiologie/Ökologie/Umweltwissenschaften o.ä.), bevorzugt werden BewerberInnen mit Doktorat
- Nachgewiesene Publikationstätigkeit national/international
- Bezug zu Gewässerökologie/Fischfauna
- Erfahrung in Organisation und Probenahme an Seen
- Praxis in DNA-Methoden (Extraktion, PCR) und kontaminationskritischen Workflows; idealerweise qPCR und/oder dPCR.
- Erfahrung in der Entwicklung und Anwendung art- und gruppenspezifischer eDNA Nachweismethoden für Fische
- Fachwissen in Hinblick auf verwendete Primer bei Fischen
- Fundierte Kenntnisse in Bioinformatik (z.B. QIIME2/DADA2 oder vergleichbar) und in R/Python für Datenanalyse
- Erfahrung hinsichtlich Referenzdatenbank-Management (Taxonomie/Barcoding)
- Sehr gute Sprachkenntnisse in Deutsch (Berichte/Leitfäden) und Englisch (Fachkommunikation)
- Bereitschaft zu Reisetätigkeit/Feldarbeit in definierten Probenahmefenstern
- Fundierte Kenntnisse zu österreichischen und nicht-heimischen Fischarten
Entlohung
Die Entlohnung erfolgt nach dem Kollektivvertrag für außeruniversitäre Forschungseinrichtungen abhängig von der Qualifikation des/der Bewerber:in, aber mindestens € 3.963,- (E1) monatlich brutto für Akademiker ohne Doktorat, bzw. € 4.757.- (F1) für Akademiker mit abgeschlossenem Doktorat. Wir bieten Gleitzeit, die Möglichkeit von Homeoffice und eine zusätzliche Unfallversicherung.
Wir bitten um aussagekräftige Bewerbungsunterlagen an research@baw.at.